蛋白结构软件 蛋白结构示意图制作
时间：2021-05-04 12:02:46
推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件 你是说做出一个蛋白质结构模型呢 还是说看蛋白质的空间结构的软件的呢都说了吧：由一条序列做出一个蛋白质结构模型最常用的方法是同源模建，软件有modeller（比较专业）
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推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件
你是说做出一个蛋白质结构模型呢 还是说看蛋白质的空间结构的软件的呢都说了吧：由一条序列做出一个蛋白质结构模型最常用的方法是同源模建，软件有modeller（比较专业） swiss-pdb-viewer（本地提交在线预测结构的）看蛋白质空间结构图的软件有：pymol ,rasmol ,vmd 还有上面这个swiss-pdb-viewer也可以看。
设计蛋白三维结构的pymol软件的外部窗口怎么安装
首先，确保电脑上已经成功安装Discovery Studio2.5（下面简称DS2.5），我有一篇经验写怎么安装DS。
DS界面如下，主要是用左侧第三栏的protocol协议 首先，打开待模建的序列，DS对文本格式要求较高，fasta文件要求首行>蛋白名，下面另起一行是蛋白序列， 打开待测序列文件， 接下来，先做序列比对，搜索待测序列的模版，使用protocol的sequence analysis模块的blast search(DS sever)，在下方打开功能模块，选项默认即可，点击窗口上方的绿色三角号，running！在左下方打开完成的job，列在最上方的模版是最佳模版，右键结构 在正式模拟前，需要将模版与模建序列比对，也是使用protocol的sequence analysis模块，点击align multiple sequences,type选项选择比对profiles，点击蓝箭头，running！比对结果， 模拟，使用protein modeling模块的build homology models，输入第五步的序列比对结果，选择模版和模建序列，点击蓝箭头，running！模建结果如下，根据dope score值选择最佳模建结果，一般值越小，结果越好。
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