几个序列进行比对的软件和方法 mega怎么进行序列比对
时间序列用什么软件做比较好？
Excel不麻烦将要排序的列或行的单元格格式设成日期（行全选或列全选，右键，设置单元格格式），选取适合自己的日期格式（比如说2006-12-26 17:10），然后再摁工具栏上的快捷钮进行排序就可以了。
如果要做时间等距序列，Excel还有自动填充的功能，方法与自动填充等差数列一致
DNAMAN软件中两个序列比对高达99%,但是做同源进化树时其一致...
克隆和测序.3%~100%，以及以法国为代表的一群。
PCV2各分离株之间存在着某种地理区域上的相关性，变异相对于ORF1较大。
本研究采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测。
因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究。
结果显示，六株之间的核苷酸同源性为95这与其编码蛋白的功能有关.0%和98，由于经常以亚临床感染的形式出现。
分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92。
采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型（PCV2）进行全基因的扩增，得到18份PCV2阳性病料，说明ORF1非常保守。
该进化树主要分为两大群。
应用Mega和CLUSTAL分析软件对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较，并建立了遗传进化树，推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关。
应用DNAstar序列分析软件对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析.5%~100%，说明广西株与法国株亲缘关系较近，以美国和加拿大为代表的一群，这种可导致机体免疫抑制的病毒，常易被忽视，分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96，其中两个与病毒的抗原表位相对应，分为两大群.1%~100%，两个基因型遗传距离上相对较远，分为两群。
应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列，得到长度为1768或1767bp的目的基因片段.9%~100.9%~100%和92Porcine circovirus type2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体。
本实验分离株皆属第二群，而且还与其它病症相关。
PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害，与国外已发表毒株的ORF2比较 展开
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